Создаем файл правил IPTABLES в удобном месте, например /etc/sysconfig/
gedit /etc/sysconfig/fw
В первой строчке этого файла должна быть строка:
#!/bin/bash
. . .
правила IPTABLES
. . .
Сохраняем файл.
chmod 750 /etc/sysconfig/fw
После открываем файл rc.local который находится в /etc/rc.d/:
gedit /etc/rc.d/rc.local
И вписываем в него строчку (в конец файла), путь до нашего файла:
/etc/sysconfig/fw
Сохраняем...
Теперь при старте системы, Ваши правила будут подгружены.