Делаю из диска iso-файл на Ubuntu 16.04

GenIsoImage - программа, предназначення для создания образов файловых систем ISO-9660 CD-ROM (или просто: iso-образ).

Установка:
# sudo aptitude install genisoimage

Создание iso:
Вставил диск в дисковод и исполняю следующую команду:
# genisoimage -V label_iso -r -o ~/name.iso /media/cdrom0

Другой способ, создать iso, это использование утилиту dd:
# dd if=/dev/cdrom of=~/name.iso