Когда-то город звали Кустанай. Еще после переименования довольно долго можно было на здании вокзала увидеть надпись именно "Кустанай", с буквой "у". Потом "у" заменили на "о".
Я по привычке пишу и называю город Кустанай. И буду его так называть до конца дней своих, мне так нравится, и мне никто не сможет этому помешать. Но правильное название города пишется через "о".
Путаницы в произношении названия города добавляет еще и тот факт, что станции не переименовались, они так и пишутся "Кустанай", по сей день.
Использовать факт написания названия станции на билете в качестве аргумента в пользу произношения названия города через "у" ошибочно. Название станции и название города вещи разные.