В мире очень много фреймворков, здесь рассматриваются только наиболее популярные.
CodeIgniter
Очень простой и быстрый фреймворк, много докуметации на русском языке. Хорошо подходит для простых по логике проектов.
Zend Framework
Фреймворк от компании Zend, разработчика ядра PHP. Очень популярен, но имеет известные проблемы с производительностью.
Довольно мощный фреймворк с реализацией ORM. При этом довольно сложен и будет тормозить на простых примерах. Используйте только для сложных проектов. Версия 2.0 теперь требует PHP 5.3.2.
Отличительные особенности: основан на самом быстром шаблонизаторе Twig, использует Doctrine ORM, мощные средства автогенерации кода.
Форк от CodeIgniter. Очень сильно развился за последнее время как по функционалу, так и по документации. Имеет реализацию ORM. Многие рекомендуют как альтернативу Zend.
YII
Фреймворк, набирающий последнее время популярность. Имеет большое российское сообщество. Работа с базами данных основывается на PDO. Более легкий и меньше есть памяти, чем Kohana. Есть минус - под Yii написано меньше расширений, чем под Kohana.